ضمن سلسلة مناقشات رسائل الماجستير في كلية الدراسات العليا ـ برنامج ماجستير المعلوماتية ـ للفصل الثاني من العام الأكاديمي 2013/2014 ناقش الطالب أحمد التميمي رسالته العلمية بعنوان " تجميع ملفات نموذج ماركوف المخفي باستخدام طريقة المقارنة بين النموذج والنموذج الآخر ". Clustering Profile Hidden Markov Models Based on Profile Alignment
أدار جلسة النقاش الدكتور رضوان طهبوب منسق برنامج المعلوماتية و رئيس دائرة هندسة وعلوم الحاسوب في كلية تكنولوجيا المعلومات وهندسة الحاسوب في جامعة بوليتكنك فلسطين، حيث افتتح المناقشة بالترحيب بالمناقشين والحضور من مدرسي الكلية وذوي الطلبة ومحاضري وطلبة برنامج ماجستير المعلوماتية.
تكونت لجنة المناقشة من الدكتور أبو السعود حنا كممتحن خارجي من جامعة بيرزيت والدكتور علاء الحلواني من جامعة بوليتكنك فلسطين كممتحن داخلي، حيث أشرف على الرسالة الدكتور هاشم التميمي مشرفا رئيسا والدكتور يعقوب الأشهب مشرفا مساعدا.
تمحورت الرسالة حول طريقة جديدة لتجميع وفهرسة ملف نموذج ماركوف المخفي حيث يعتبر ملف نموذج ماركوف المخفي تمثيلًا إحصائيا للمتسلسلات الجينية للبروتينات على مستوى العائلة. حالياً يوجد العديد من قواعد البيانات التي تحفظ البروتينات من خلال تمثيلها بملفات نموذج ماركوف المخفي. علماً أن حجم قواعد البيانات تزداد طرديا.
هدفت الأطروحة إلى فهرسة ملفات نموذج ماركوف المخفي بطريقة لاسترجاع النماذج المماثلة بكفاءة ودقة عالية. حيث توصل الطالب أحمد التميمي في هذه الأطروحة إلى طريقة جديدة لتجميع هذه النماذج على أساس التشابه فيما بينها وباستخدام طريقة المقارنة بين النموذج والنموذج الآخر، وتستخدم المجموعات الناتجة كأساس لفهرسة قواعد البيانات الخاصة بها. ولقد تم استخدام ومقارنة ثلاثة خوارزميات مختلفة في التجميع وهم: التجميع الهرمي والتجميع الثابت الوسطي والتجميع بواسطة الكيانات المتصلة.
وقد أظهرت النتائج انه بإمكان نظام الفهرسة التوفير في وقت استرجاع النماذج المتشابه من قواعد البيانات بنسبة تصل إلى %54.69 و %68.53 و%60.07 على التوالي لكل خوارزمية. وأيضا حققنا دقة عاليه تصل إلى %96.22 و %90.23 و %86.88. على التوالي، كما انه تم الحصول على هذه النتائج العالية بعد تطبيق تقنية التجميع المتداخل مع خوارزمية التجميع المستخدمة.
وبعد عرض الطالب لنتائج دراسته العلمية والمداولات بين أعضاء اللجنة الممتحنة والتي تمت بشكل علمي وبمهنية عالية تم منح الطالب أحمد التميمي درجة الماجستير في المعلوماتية مشيدة بالجهد العلمي المبذول وبما ورد فيها من نتائج وتوصيات.
ومن الجدير ذكره أن برنامج ماجستير المعلوماتية والمرخص من وزارة التعليم العالي من البرامج المميّزة في هذا المجال على صعيد الوطن. يتميّز البرنامج من خلال تخريج فوج من الباحثين الشباب الذين أظهروا قدرات كبيرة في التحليل والاستنتاج من خلال الرسائل العلمية والبحثية التي تقدموا بها للحصول على درجة الماجستير في المعلوماتية، كما أن احتواء البرنامج على عديد الكفاءات العلمية فتح أمام الطلبة آفاقاً جديدة للبحث العلمي، وكان للمشرفين الدور الأبرز في توجيه الطلبة لتوفير حلول ناجعة للمشاكل التي يعاني منها المجتمع الفلسطيني في المجالات المختلفة.
دائرة العلاقات العامة